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本发明提供了一种具有虹吸结构的萃取分离设备，属于萃取设备领域，其包括萃取主体、虹吸管、控制装置和扫描设备，萃取主体底部安装有连通萃取主体内部的出液管，出液管上安装有液阀；萃取主体的侧壁上设置有刻度线，刻度线所在部分的侧壁采用透明材料制作；虹吸管呈U型结构，虹吸管的一端从萃取主体的顶部伸入萃取主体内，并插入萃取主体内的液体中，虹吸管的另一端位于萃取主体外侧，且该端端口位于伸入萃取主体内的一端端口下方；虹吸管安装在滑动驱动装置上；控制装置分别电连接滑动驱动装置和扫描设备；扫描设备的扫描部分正对萃取主体刻度线所在部分，扫描设备与萃取主体滑动连接。本发明可自动获取各分层液，且精确度较高。