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本发明属于数据安全领域，提供一种非平衡隐私集合求交计算方法、系统、设备及介质，包括服务器对服务输入集合进行哈希映射并加密生成密态双重置换布谷鸟哈希表并发送给云辅助服务器；客户端对客户输入集合进行哈希映射并加密生成密态虚拟置换布谷鸟哈希表并发送给云辅助服务器；云辅助服务器根据密态虚拟置换布谷鸟哈希表中元素的虚拟索引信息定位密态双重置换布谷鸟哈希表中需比较的元素并进行同态运算，得到密文结果并发送给客户端；客户端对密文结果进行解密得到明文结果集合，根据明文结果集合是否等于零来确定交集。本发明使得客户端通信开销仅与自身数据集合规模相关，并降低元素比较阶段的计算复杂度。